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Unidad I
ALL YOU NEED TO KNOW
         BY
 BR. CARLOS PEDROZA
Universidad Central de Venezuela
           Facultad de Medicina
        Escuela “José María Vargas”
           Cátedra de Bioquímica

PROTEÍNAS y AMINOÁCIDOS
     Estructura y Propiedades




             Br. Carlos Pedroza
                                         Unidad I
Estructura de Proteínas y
     Aminoácidos
    ALL YOU NEED TO KNOW
             BY
     BR. CARLOS PEDROZA
Esquema



                                              Métodos de
Aminoácidos      Proteínas
                                              Separación




                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema



                                              Métodos de
Aminoácidos      Proteínas
                                              Separación




                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                  Péptidos – Proteínas
                         Pro                    Pro
                Met                  Pro
                         Gly                    Lys
                Ala                  Ala
                         Gly                    Ser
                Cys                  Phe
                         Gln                    Arg
                Pro                  Tyr
                         Pro                    Pro

                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                 Péptidos – Proteínas
                Transportadores de NH3




                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                  Péptidos – Proteínas
                Transportadores de NH3
               Intermediarios Metabólicos


                 Arginina
                                       Ciclo de la
                 Citrulina
                                          Urea
                 Ornitina



                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                  Péptidos – Proteínas
                Transportadores de NH3
               Intermediarios Metabólicos
                         Precursores

                            Glucosa
                             Hemo
                           Cetoácidos
                           Nucleótidos

                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                  Péptidos – Proteínas
                Transportadores de NH3
               Intermediarios Metabólicos
                         Precursores
                   Neurotransmisores

                            Glutamato
                            Aspartato
                             Glicina
                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Importancia Biológica
                  Péptidos – Proteínas
                Transportadores de NH3
               Intermediarios Metabólicos
                         Precursores
                   Neurotransmisores
                        Fosfolípidos


                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Estructura General
              Hidrógeno                              Cadena Lateral
                                            Varía en estructura, tamaño y carga
                                                          eléctrica

                                            Influyen en su solubilidad en agua




Grupo amino                                                 Grupo carboxilo
                                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Estructura General

                           1.- Carbono

                           2.- Grupo Amino

                           3.- Grupo Carboxilo

                           4.- Hidrógeno

                           5.- Cadena Lateral


               Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales




                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales




                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales

                                            His                    Val
                                 Met                    Ile



  300              20
                                            Gly                    Tyr
                                 Ala                   Leu
                                            Glu                    Trp
                                 Arg                    Lys
Aminoácidos     Aminoácidos                 Gln                    Thr
                                 Asn                   Phe
                                            Cys                    Ser
                                 Asp                   Pro

                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isómeros


  “Moléculas con la misma fórmula
 molecular pero con distinta fórmula
estructural o con diferente disposición
               espacial”


                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isómeros




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isómeros


   COO-                                COO-

   CH                                  CH

   CH                               HC

   COO-                                COO-

Maleato (Cis)                   Fumarato (Trans)


                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isómeros


H             COO-              -OOC                H

        C                                   C

        C                                   C

H             COO-                  H               COO-

    Maleato (Cis)                    Fumarato (Trans)
     C4H2O4                             C4H2O4

                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

      Estructural                     Espacial

                              “Presentan los mismos
 “Presentan los mismos
                              átomos pero enlazados
 átomos y difieren en el
                               covalentemente con
orden en que se enlazan a
                               diferente orientación
      la molécula”
                                     espacial”


                                  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Estructural                  Espacial
 De cadena               Conformacional
De posición                        Eclipsada
                                   Alternada
De función
                         Configuracional
                         Geométrica (Trans y Cis)
                         Óptica → Carbono quiral
                         Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                         Enantiómeros y Diasteroisómeros
                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Estructural                  Espacial
 De cadena               Conformacional
De posición                        Eclipsada
                                   Alternada
De función
                         Configuracional
                         Geométrica (Trans y Cis)
                         Óptica → Carbono quiral
                         Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                         Enantiómeros y Diasteroisómeros
                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Estructural
 De cadena
De posición
De función




                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

      Estructural                     CH3     CH2        CH2       CH3
       De cadena                                  Butano
                                                  C4H10
      De posición
       De función                                  CH3

                                          CH3       CH        CH3
   = Fórmula molecular
≠Representación de la cadena                 Metil-propano
                                                C4H10

                                            Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

      Estructural                          OH
        De cadena
                                           CH2     CH2        CH3
       De posición                               1-Propanol
                                                   C3H8O
       De función
                                                    OH

   = Fórmula molecular                     CH3      CH        CH3
≠Posición del grupo funcional
                                                 2-Propanol
                                                   C3H8O
                                            Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

  Estructural
                                    Interconversiones
   De cadena                     Cicloalcanos ↔ Alquenos
  De posición                    Cicloalquenos ↔ Alquinos
                                    Aldehído ↔ Cetona
   De función                         Alcohol ↔ Éter
                                 Ácido carboxílico ↔ Éster


= Fórmula molecular
≠ Tipo de compuesto


                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

  Estructural
   De cadena
  De posición
   De función

= Fórmula molecular        D-Gliceraldehído            Dihidroxiacetona
≠ Tipo de compuesto            Aldosa                       Cetosa
                              C3H6O3                       C3H6O3

                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

  Estructural                    CH3     CH2        OH
   De cadena                            Etanol
                                        C2H6O
  De posición
   De función
                                 CH3       O        CH3
= Fórmula molecular                  Dimetil éter
≠ Tipo de compuesto                    C2H6O


                                  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Estructural                  Espacial
 De cadena               Conformacional
De posición                        Eclipsada
                                   Alternada
De función
                         Configuracional
                         Geométrica (Trans y Cis)
                         Óptica → Carbono quiral
                         Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                         Enantiómeros y Diasteroisómeros
                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

               Espacial
           Conformacional
                     Eclipsada
                     Alternada
           Configuracional
           Geométrica (Trans y Cis)
           Óptica → Carbono quiral
           Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
           Enantiómeros y Diasteroisómeros
           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                         Espacial
“Tipo de disposición espacial
 de ciertos grupos químicos,         Conformacional
 por rotación alrededor de un                  Eclipsada
        enlace simple.                         Alternada
                                     Configuracional
   Su interconversión NO
                                     Geométrica (Trans y Cis)
requiere de ruptura de enlaces       Óptica → Carbono quiral
         covalentes”                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                     Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Vista Lateral                                Espacial
Representación en caballete
                                         Conformacional
                                                   Eclipsada
                                                   Alternada
                                         Configuracional
                                         Geométrica (Trans y Cis)
                                         Óptica → Carbono quiral
                      Etano              Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                      C2H6               Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Proyección de Newman                           Espacial
Disposición Eclipsada
                                           Conformacional
                                                     Eclipsada
                                                     Alternada
                                           Configuracional
                                           Geométrica (Trans y Cis)
                                           Óptica → Carbono quiral
                        Etano              Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                        C2H6               Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Proyección de Newman                           Espacial
Disposición Alternada
                                           Conformacional
                                                     Eclipsada
                                                     Alternada
                                           Configuracional
                                           Geométrica (Trans y Cis)
                                           Óptica → Carbono quiral
                                           Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                        Etano              Enantiómeros y Diasteroisómeros
                        C2H6
                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

        “Los cambios                    Espacial
 conformacionales buscan la         Conformacional
disposición de menor energía                  Eclipsada
       libre de Gibbs.
                                              Alternada
 Permiten a las biomoléculas
(como las proteínas) plegarse       Configuracional
      hasta alcanzar la             Geométrica (Trans y Cis)
conformación más estable (de        Óptica → Carbono quiral
                                    Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
    menor energía libre)”           Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                         Espacial
“Tipo de disposición espacial
 de ciertos grupos químicos,         Conformacional
alrededor de un doble enlace o                 Eclipsada
     de un carbono quiral.                     Alternada
                                     Configuracional
 Su interconversión requiere
                                     Geométrica (Trans y Cis)
    de ruptura de enlaces            Óptica → Carbono quiral
         covalentes”                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                     Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                            Espacial
-OOC         H      H          COO-
                                        Conformacional
        C                C                        Eclipsada
        C                C                        Alternada
                                        Configuracional
  H          COO-   H          COO-
                                        Geométrica (Trans y Cis)
 Fumarato (Trans)   Maleato (Cis)       Óptica → Carbono quiral
    C4H2O4           C4H2O4             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                        Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                    Espacial
                                Conformacional
    H         O
        C                                 Eclipsada
                                          Alternada
H       C     OH
                                Configuracional
        CH3                     Geométrica (Trans y Cis)
2-Hidroxi-Propanal              Óptica → Carbono quiral
     C3H6O2                     Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

    Carbono                            Espacial
   asimétrico                      Conformacional
                                             Eclipsada
 “Es aquel carbono                           Alternada
 unido, por enlaces                Configuracional
  simples, a cuatro                Geométrica (Trans y Cis)
grupos sustituyentes               Óptica → Carbono quiral
 diferentes entre sí”              Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                    Espacial
                                Conformacional
    H         O
        C                                 Eclipsada
                                          Alternada
H       C     OH
                                Configuracional
        CH3                     Geométrica (Trans y Cis)
2-Hidroxi-Propanal              Óptica → Carbono quiral
     C3H6O2                     Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                    Espacial
                                Conformacional
    H         O
        C                                 Eclipsada
                                          Alternada
H       C     OH
                                Configuracional
        CH3                     Geométrica (Trans y Cis)
2-Hidroxi-Propanal              Óptica → Carbono quiral
     C3H6O2                     Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                    Espacial
                                Conformacional
    H         O
        C                                 Eclipsada
                                          Alternada
H       C     OH
                                Configuracional
        CH3                     Geométrica (Trans y Cis)
2-Hidroxi-Propanal              Óptica → Carbono quiral
     C3H6O2                     Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

“Existen moléculas que                   Espacial
 coinciden en todas sus              Conformacional
propiedades excepto en                         Eclipsada
su capacidad de desviar
                                               Alternada
     el plano de luz
       polarizada.                   Configuracional
                                     Geométrica (Trans y Cis)
   Son los llamados                  Óptica → Carbono quiral
                                     Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
  Isómeros ópticos”.                 Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería
        Isómeros Ópticos del Ácido Láctico

      Nombre
                         Ácido (+)
                          láctico
                                        Ácido (-)
                                         láctico
                                                        Espacial
                                                    Conformacional
     Estructura
                                                              Eclipsada
   Punto de fusión         26oC          26oC                 Alternada
   Densidad (25o)          1,248         1,248
 Solubilidad en agua        ∞                 ∞
                                                    Configuracional
                                                    Geométrica (Trans y Cis)
Solubilidad en alcohol      ∞                 ∞
                                                    Óptica → Carbono quiral
        pKa                3,86              3,86   Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
        [ ]D25             +3,8              -3,8   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Dextrorrotatorios y Levorrotatorios                  Espacial
                                                 Conformacional
                                                           Eclipsada
                                                           Alternada
                                                 Configuracional
                                                 Geométrica (Trans y Cis)
                                                 Óptica → Carbono quiral
                                                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                 Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Dextrorrotatorios y Levorrotatorios                              Espacial
                                                             Conformacional
 Fuente de luz      Luz no        Filtro             Tubo de muestraEclipsada
                                                                           Filtro
    blanca         polarizada   polarizador                              polarizador
                                                                       Alternada
                                                             Configuracional
                                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                                             Óptica → Carbono quiral
                                              Plano de luz   Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                              polarizada     Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
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Dextrorrotatorios y Levorrotatorios                  Espacial
                                                 Conformacional
                                                           Eclipsada
                                                           Alternada
                                                 Configuracional
                                                 Geométrica (Trans y Cis)
                                                 Óptica → Carbono quiral
                                                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                 Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Dextrorrotatorios y Levorrotatorios                  Espacial
               Levorrotatorio
                  (l) ó (-)
                                                 Conformacional
              Dextrorrotatorio                             Eclipsada
                 (d) ó (+)                                 Alternada
                                                 Configuracional
                                                 Geométrica (Trans y Cis)
                                                 Óptica → Carbono quiral
                                                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                 Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
                                                       Eclipsada

 ¿Por qué sucede                                       Alternada
                                             Configuracional
      esto?                                  Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
      Plano de Simetría
                                                       Eclipsada
  “El que divide una figura o un                       Alternada
 cuerpo en dos partes iguales, de            Configuracional
 tal modo que cada una de ellas              Geométrica (Trans y Cis)
   es la imagen especular de la              Óptica → Carbono quiral
              otra”                          Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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                                             Conformacional
                                                       Eclipsada
                                                       Alternada
                                             Configuracional
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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                                             Conformacional
                                                       Eclipsada
                                                       Alternada
                                             Configuracional
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
                                                       Eclipsada
                                                       Alternada
                                             Configuracional
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
                                                       Eclipsada
                                                       Alternada
                                             Configuracional
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
                                                       Eclipsada
                                                       Alternada
                                             Configuracional
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
         Isómeros ópticos,                   Conformacional
          Enantiómeros o                               Eclipsada
          Enantiomorfos                                Alternada

     “Aquellos compuestos que
                                             Configuracional
   carecen de plano de simetría y            Geométrica (Trans y Cis)
    que son simétricos entre sí o            Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
   imágenes especulares entre sí”            Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
    ¿Y si hay más                                      Eclipsada
                                                       Alternada
    de un carbono                            Configuracional

     asimétrico?
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
                                             Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
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Enantiómeros y Diasteroisómeros                  Espacial
                                             Conformacional
                                                       Eclipsada

    Número de     =
                                  2 n                  Alternada
                                             Configuracional
  estereoisómeros
                                             Geométrica (Trans y Cis)
                                             Óptica → Carbono quiral
   n → Número de carbonos asimétricos        Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                             Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
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                                                                  Enantiómeros

                                                                  Diasteroisómeros
Enantiómeros y Diasteroisómeros                         Espacial
       CH3                    CH3                CHConformacional 3
                                                    3              CH
                                                         Eclipsada
  X      C     H        H         C    X   X      C   H       H     C                     X
                                                        Alternada
  Y      C     H        H         C    Y   H      C   Y       Y     C                     H
                                                    Configuracional
       CH3                    CH3                CH3Geométrica (Trans y Cis)
                                                                    CH3
                                                   Óptica → Carbono quiral
                                                    Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                    Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Enantiómeros y Diasteroisómeros                        Espacial
                                                   Conformacional
                   Enantiómero
             Isómeros espaciales que son                     Eclipsada
            imágenes especulares entre sí                    Alternada
                 Diasteroisómero                   Configuracional
          Isómeros espaciales que NO son
            imágenes especulares entre sí          Geométrica (Trans y Cis)
                                                   Óptica → Carbono quiral
                                                   Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Enantiómeros y Diasteroisómeros                              Espacial
                                                         Conformacional
                             Iguales características
                                                                   Eclipsada
           Enantiómeros
                               físicas y químicas                  Alternada
                                   Diferentes
          Diasteroisómeros   características físicas y   Configuracional
                                    químicas
                                                         Geométrica (Trans y Cis)
                                                         Óptica → Carbono quiral
                                                         Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                         Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Nomenclatura de los Isómeros Ópticos              Espacial
      Cuando sólo hay un                      Conformacional
      carbono asimétrico                                Eclipsada
           Nomenclatura D-L
                                                        Alternada
          Proyección de Fischer.
                                              Configuracional
    Cuando hay uno o más
                                              Geométrica (Trans y Cis)
     carbonos asimétricos                     Óptica → Carbono quiral
           Nomenclatura R-S                   Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
           Convención CIP                     Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

                                                       Espacial
      1º.- La cadena carbonada se sitúa en         Conformacional
vertical, con las valencias que la integran en
dirección a la parte posterior del plano.
                                                             Eclipsada
      2º.- La cadena se orienta con la parte                 Alternada
más oxidada hacia arriba y la más reducida
hacia abajo.
                                                   Configuracional
      3º.- Las valencias que no integran la        Geométrica (Trans y Cis)
cadena carbonada resultan horizontales y           Óptica → Carbono quiral
dirigidas hacia la parte anterior del plano.       Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
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                                                       Espacial
      1º.- La cadena carbonada se sitúa en         Conformacional
vertical, con las valencias que la integran en
dirección a la parte posterior del plano.
                                                             Eclipsada
      2º.- La cadena se orienta con la parte                 Alternada
más oxidada hacia arriba y la más reducida
hacia abajo.
                                                   Configuracional
      3º.- Las valencias que no integran la        Geométrica (Trans y Cis)
cadena carbonada resultan horizontales y           Óptica → Carbono quiral
dirigidas hacia la parte anterior del plano.       Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
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                                                       Espacial
      1º.- La cadena carbonada se sitúa en         Conformacional
vertical, con las valencias que la integran en
dirección a la parte posterior del plano.
                                                             Eclipsada
      2º.- La cadena se orienta con la parte                 Alternada
más oxidada hacia arriba y la más reducida
hacia abajo.
                                                   Configuracional
      3º.- Las valencias que no integran la        Geométrica (Trans y Cis)
cadena carbonada resultan horizontales y           Óptica → Carbono quiral
dirigidas hacia la parte anterior del plano.       Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                   Enantiómeros y Diasteroisómeros
                                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
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                             ¡Ten cuidado!
Nomenclatura de los Isómeros Ópticos                  Espacial
                                                 Conformacional
               ¡Nomenclatura D-L ≠ Rotación específica (+) (-)!
                                                        Eclipsada
                                                            Alternada
                                                 Configuracional
                                                 Geométrica (Trans y Cis)
                                                 Óptica → Carbono quiral
                                                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                 Enantiómeros y Diasteroisómeros

                                                  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Isomería

Nomenclatura de los Isómeros Ópticos                 Espacial
                     ¡Recuerda siempre!
                                   Conformacional
                                                           Eclipsada
       Todos los aminoácidos que constituyen a las
                                         Alternada

                                proteínas son: Configuracional
                                                Geométrica (Trans y Cis)
           -aminoácidos                       L-aminoácidos
                                                Óptica → Carbono quiral
                                                 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios
                                                 Enantiómeros y Diasteroisómeros

                                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Abreviaciones

  Alanine       Ala   A      Glycine       Gly   G               Proline         Pro     P

  Arginine      Arg   R      Histidine     His   H               Serine          Ser     S

 Asparagine     Asn   N     Isoleucine     Ile   I             Threonine         Thr     T

Aspartic Acid   Asp   D      Leucine       Leu   L             Tryptophan        Trp     W

  Cysteine      Cys   C       Lysine       Lys   K              Tyrosine         Tyr     Y

 Glutamine      Gln   Q     Methionine     Met   M               Valine          Val     V

Glutamic Acid   Glu   E    Phenylalanine   Phe   F


                                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación

 Esencial       No Esencial
  Arginine         Alanine
  Histidine      Asparagine
 Isoleucine       Aspartate
  Leucine         Cysteine
   Lysine         Glutamate
 Methionine      Glutamine
Phenylalanine      Glycine
 Threonine         Proline
 Tryptophan        Serine
   Valine         Tyrosine


                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
Alifáticos                                                              Sin Carga
- No polares -                   Aromáticos                              - Polares -
   Glycine                       - No polares -                             Serine
   Alanine                       Phenylalanine                            Threonine
   Proline                         Tyrosine                               Cysteine
    Valine                        Tryptophan                             Asparagine
   Leucine                                                               Glutamine
  Isoleucine
 Methionine
                 Carga Negativa                Carga Positiva
                    - Ácidos -                    - Básicos -
                    Aspartato                       Lysine
                    Glutamato                     Histidine
                                                  Arginine
                                                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación de los Aminoácidos




  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Aminoácidos no comunes




                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos
             COOH                       COO-                               COO-
   +H        C     H         +H         C      H                           C        H
        3N                         3N                        H2N

             R                          R                                  R


        Zwitterión                                         Anfótero
   “Molécula eléctricamente
neutra, pero que presenta cargas                   “Se dice de las moléculas
 parciales positivas y negativas                     que pueden reaccionar
   en átomos diferentes de su
                                                   como ácido o como base”.
           estructura”
                                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos
          COOH                      COO-                             COO-
+H        C   H           +H        C      H                         C        H
     3N                        3N                      H2N

          R                         R                                R




                 Forma no iónica                  Zwitterión

                                               Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos

2                                  7                                           12
    Ácido                                                        Base
    ↑[H+] → ↑[Formas protonadas]       ↓[H+] → ↑[Formas no protonadas]




pH =                               -log[H+]
                                               Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos

2                                  7                                           12
    Ácido                                                        Base
    ↑[H+] → ↑[Formas protonadas]       ↓[H+] → ↑[Formas no protonadas]




pH =                               -log[H+]
                                               Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos


                                          pKa del Grupo Carboxilo

       COO-                                   [COOH] =[COO-]
                                           pKa del Grupo Amino

+H N   C      H                                  [NH3+]=[NH2]
  3
                                               pKa del Grupo R
                 Aminoácidos                  [COOH] =[COO-]
       R   Básicos (lisina, histidina y
               arginina), Ácidos
                                                [NH3+]=[NH2]
           (aspartato y glutamato) y
                                                 [OH] = [O-]
             Tirosina y Cisteína                  [SH] = [S-]
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos



       COOH           COO-                            COO-
+H             +H                    +H
  3N   C   H     3N   C   H               3N          C         H

       R              R                               R


                 R-NH3
α-COOH          R-COOH                   α-NH3

                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Ionización de los Aminoácidos



                 α-COOH         α-NH3+         Side

       COO-       group         group          Chain




+H N   C   H
  3

       R

               Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos



pH = pKa + log[Forma desprotonada]
                               [Forma protonada]

 [Forma desprotonadapKaForma protonada]
                    ]=[
   pH donde el ácido está parcialmente disociado
            pH = pK
    [Forma desprotonada]=[Forma protonada]

                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos
Ecuación de Henderson-Hasselbach




                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos
Ecuación de Henderson-Hasselbach




                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos


       COOH           COO-                                COO-
+H             +H                        +H
  3N   C   H     3N   C      H                3N          C         H

       R              R                                   R


                     R-NH3
 α-COOH             R-COOH                       α-NH3

                                  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos
Punto isoeléctrico




                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos
Punto isoeléctrico




                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos
Punto isoeléctrico




                          pK (1)  pK (1)
                     pI 
                                  2
                                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,34
pK2 →9,60
                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,34   pI 
                  pK1  pK 2
pK2 →9,60             2
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,34   pI 
                  pK1  pK 2
                              5,97
pK2 →9,60             2
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,34
pK2 →9,60

pI → 5,97

                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,19
pKR →4,25
pK2 →9,67
                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,19
                  pK1  pK R
pKR →4,25    pI 
                      2
pK2 →9,67
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 2,19
                  pK1  pK R
pKR →4,25    pI              3,22
                      2
pK2 →9,67
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos



pK1 → 2,19
pKR →4,25
pK2 →9,67

pI → 3,22

                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 1,82
pKR →6,00
pK2 →9,17
                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 1,82
                  pK R  pK 2
pKR →6,00    pI 
                       2
pK2 →9,17
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos




pK1 → 1,82
                  pK R  pK 2
pKR →6,00    pI               7,58
                       2
pK2 →9,17
                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Curva de titulación de los Aminoácidos



pK1 → 1,82
pKR →6,00
pK2 →9,17

pI → 7,58

                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Índice de Hidrofobicidad

Hidrofílico                         Hidrofóbico
     -3    -2   -1   0    1          2            3




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Aminoácidos


                                                              Nomenclatura,
  Importancia     Estructura
                                   Esteroisomería             clasificación y
   Biológica       general
                                                              abreviaciones



                                      Curva de                 Ionización de
    Enlace        Índice de
                                  titulación de los                 los
   peptídico    Hidrofobicidad
                                    Aminoácidos                Aminoácidos


                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico




    Reacción de
   Condensación
“Reacción orgánica en la cual
 dos moléculas se combinan
con eliminación de moléculas
          de agua”




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar
  4.   Conformación Trans




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar
  4.   Conformación Trans
  5.   Rígida



Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar
  4.   Conformación Trans
  5.   Rígida
  6.   Más corto

Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar
  4.   Conformación Trans
  5.   Rígida
  6.   Más corto
  7.   Puentes de H2
Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico

 Características

  1.   Tipo Amida
  2.   Posee “resonancia”
  3.   Carácter Polar
  4.   Conformación Trans
  5.   Rígida
  6.   Más corto
  7.   Puentes de H2
Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Enlace Peptídico




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema



                                              Métodos de
Aminoácidos      Proteínas
                                              Separación




                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Proteínas


      Características                     Niveles
       Generales                        Estructurales


                                                         Estructura de
                        Clasificación                  algunas proteínas
                                                        de importancia
                                                           biológica
                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Proteínas


      Características                     Niveles
       Generales                        Estructurales


                                                         Estructura de
                        Clasificación                  algunas proteínas
                                                        de importancia
                                                           biológica
                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales




Oligopéptidos (<15 aa)
Polipéptidos (15-100 aa)
  Proteínas (>100 aa)



    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales

           Vasopresina




           Glutation
                         Troponina C

Insulina

                                                                  GramicidinaS
                                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales

        Algunas funciones de las proteínas
   Enzimas                          [...]
  Transporte            Hemoglobina, lipoproteínas
  Nutrientes               Ovoalbúmina, caseína
 De Reserva                       Ferritina
 Contráctiles             Actina, miosina, tubulina
 Estructurales             Colágeno, queratinas
   Defensa          Ig, trombina, veneno de serpientes
 Reguladoras                     Hormonas
Otras funciones          Anticongelantes, monelina
                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales




                                    Constituyentes
5.000 → 1.000.000
                                     H, C, N, D, S
     Daltons
                                    (Zn, Fe, Cu, P)




                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Características Generales




“Una secuencia primaria sólo puede adoptar una (o
   muy pocas) conformaciones en el espacio”


 Mayor estabilidad → Mínima cantidad de energía libre (G)
        Restricción de movimiento del enlace peptídico
                 Características de los grupos R




                                            Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Propiedades

              Solubilidad
              Especificidad
        Capacidad Amortiguadora
Presión Coloidosmótica o Presión Oncótica
         Precipitación Selectiva
  Desnaturalización y Renaturalización
                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Propiedades

   Desnaturalización y Renaturalización
   Proteína                           Desnaturalización                   Proteína
Desnaturalizada                       Renaturalización                     Nativa
                       Proteína Desnaturalizada ↔ Proteína Nativa
       Irregular, variable, abierta                           Regular compacta
   Ausencia de estructura secundaria                 Presencia de estructura secundaria
    Pocos enlaces intramoleculares                 Abundancia de enlaces intramoleculares
   Residuos hidrofóbicos expuestos                   Residuos hidrofóbicos no expuestos
     Enlaces disulfuros reducidos                         Enlaces disulfuros oxidados
       Catalíticamente inactivos                            Catalíticamente activos
                                                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Proteínas


      Características                     Niveles
       Generales                        Estructurales


                                                         Estructura de
                        Clasificación                  algunas proteínas
                                                        de importancia
                                                           biológica
                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación

    Según su composición
Según el número de subunidades
      Según su estructura
       Según su función


                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
                            Según su composición




Simples                        Conjugadas
                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
                                                Según su composición
    Clase          Grupo prostético               Ejemplo
 Lipoproteína            Lípidos                     [...]
Glucoproteína           Glúcidos             Inmunoglobulina G
 Fosfoproteína      Grupos fosfatos           Caseína de la leche
Hemoproteína      Hemo (ferroporfirina)         Hemoglobina
 Flavoproteína    Nucleótidos de flavina   Succinato deshidrogenasa
                         Hierro                    Ferritina
                          Zinc             Alcohol deshidrogenasa
Metaloproteínas          Calcio                  Calmodulina
                       Molibdeno                Dinitrogenasa
                         Cobre                  Plastocianina

                                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
                        Según el número de subunidades




Monomérica                        Multimérica
                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
                               Según su estructura




Fibrosas                        Globulares
                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Clasificación
                                     Según su función




Estructurales                         Dinámicas
                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Proteínas


      Características                     Niveles
       Generales                        Estructurales


                                                         Estructura de
                        Clasificación                  algunas proteínas
                                                        de importancia
                                                           biológica
                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales




Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales




Niveles de Organización de las
          Proteínas




                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria




                      Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria




                      Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria
      La estructura primaria determina la estructura secundaria, terciaria (y cuaternaria) de las proteínas

                                   Se encuentran en la región interna de las proteínas o interaccionando con alguna otra
           Hidrófobos
                                  región hidrofóbica, evitando el contacto con el agua→ Cremalleras de leucina, bolsillos
   (Alifáticos y Aromáticos)
                                                hidrófobos, alfa hélices hidrófobas. Tirosina y el triptófano.

             Polares                Se ubican en la superficie proteica en contacto con el agua, iones y otras moléculas
  (Sin carga, ácidos y básicos)            polares. Posibilitan la solubilidad de la proteína en el medio acuoso.

                                  Puede oxidarse para formar puentes disulfuro (-S-S-) con una segunda cisteína ubicada
            Cisteína
                                    en la misma cadena polipepídica o en una cadena diferente → Mayor estabilidad.

                                      Puede ubicarse en lugares muy estrechos dentro de la proteína o ser un factor
            Glicina
                                        desestabilizante debido a que permite una mayor libertad de movimiento

                                      Permite cambios bruscos en la dirección de la cadena polipeptídica y limita la
            Prolina
                                                  posibilidad de movimiento aleatorio de la cadena.
                                                                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria
      1        A   A   S   X D X S L V E V H X X      V   F   I   V   P   P   X   I   L   Q   A   V   V   S   I   A
      31       T   T   R   X D D X D S A A A S I      P   M   V   P   G   W   V   L   K   Q   V   X   G   S   Q   A
      61       G   S   F   L A I V M G G G D L E      V   I   L   I   X   L   A   G   Y   Q   E   S   S   I   X   A
      91       S   R   S   L A A S M X T T A I P      S   D   L   W   G   N   X   A   X   S   N   A   A   F   S   S
      121      X   E   F   S S X A G S V P L G F      T   F   X   E   A   G   A   K   E   X   V   I   K   G   Q   I
      151      T   X   Q   A X A F S L A X L X K      L   I   S   A   M   X   N   A   X   F   P   A   G   D   X   X
      181      X   X   V   A D I X D S H G I L X      X   V   N   Y   T   D   A   X   I   K   M   G   I   I   F   G
      211      S   G   V   N A A Y W C D S T X I      A   D   A   A   D   A   G   X   X   G   G   A   G   X   M   X
      241      V   C   C   X Q D S F R K A F P S      L   P   Q   I   X   Y   X   X   T   L   N   X   X   S   P   X
      271      A   X   K   T F E K N S X A K N X      G   Q   S   L   R   D   V   L   M   X   Y   K   X   X   G   Q
      301      X   H   X   X X A X D F X A A N V      E   N   S   S   Y   P   A   K   I   Q   K   L   P   H   F   D
      331      L   R   X   X X D L F X G D Q G I      A   X   K   T   X   M   K   X   V   V   R   R   X   L   F   L
      361      I   A   A   Y A F R L V V C X I X      A   I   C   Q   K   K   G   Y   S   S   G   H   I   A   A   X
                           Saccharomyces cerevisiae
      391      G   S   X   R D Y S G F S X N S A      T   X   N   X   N   I   Y   G   W   P   Q   S   A   X   X   S
      421      K   P   I   X I T P A I D G E G A      A   X   X   V   I   X   S   I   A   S   S   Q   X   X   X   A
      451      X   X   S   A X X A
                                                                      Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria
                              Nº de posibilidades de secuencias
                 Tripéptido                    3!                 6 secuencias

               Péptido de 20aa                 20!          2,43 x 1018 secuencias

               Péptido de 60aa                 60!          8,32 x 1081 secuencias


                                     1   Met   Asn   Leu
                                     2   Met   Leu   Asn
                                     3   Asn   Leu   Met
                                     4   Asn   Met   Leu
                                     5   Leu   Asn   Met
                                     6   Leu   Met   Asn
                                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Primaria
                                  Nº de posibilidades de secuencias
                 Tripéptido                      3!                       6 secuencias

               Péptido de 20aa                   20!                 2,43 x 1018 secuencias

               Péptido de 60aa                   60!                 8,32 x 1081 secuencias


                         Patologías por alteración de la estructura primaria
                 Anemia falciforme                           Hemoglobina
                Hipercolesterolemia                          Receptor LDL
                      Porfirias                    Enzimas del metabolismo del hemo
               Síndrome Lesh-Nyham                Hipoxantina fosforribosil transferasa
                       Gota                                 Xantina oxidasa

                                                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales




Niveles de Organización de las
          Proteínas




                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria




             “Arreglo espacial de los residuos       Hélice α
            de AA adyacentes en una cadena          Laminas β
              polipeptídica que se repite de         Giros β
            forma regular dando origen a una       Estructuras
                  estructura periódica”          supersecundarias
                                                      Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α

             Estabiliza                     Desestabilizan
  1. Puentes      de     hidrógeno
  intracatenarios paralelos al eje
                                      1. Grupos R voluminosos
  entre el oxígeno carbonilo y el
                                      2. Secuencias con densidad de
  hidrógeno de la amida del cuarto
                                      carga del mismo signo
  residuo
                                      3. Glicina y prolina
  2. Aminoácidos polares
  3. Interacciones de van der Waals

                                            Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Lámina u hoja β plegada




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Lámina u hoja β plegada




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Lámina u hoja β plegada




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Lámina u hoja β plegada




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Lámina u hoja β plegada




                              Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Hélice α y Lámina u hoja β plegada
         Características                        Hélice α                         Lámina u hoja β plegada
              Forma                               Hélice                         Cadena extendida o zig-zag
    Disposición de las cadenas
                                             Hacia el exterior                           Alternados
             laterales

      Enlaces de hidrógeno         Intracatenarios (cada 4 aminoácidos)                Intercatenarios

                                           -Puentes de hidrógeno
    Fuerzas que la estabilizan             -Aminoácidos polares                      -Grupos R pequeños
                                      -Interacciones de van der Waals

                                         -Grupos R voluminosos
                                                                                  -Grupos R voluminosos
                                   -Secuencias con densidad de carga del
   Fuerzas que la desestabilizan                                            -Secuencias con densidad de carga del
                                               mismo signo
                                                                                        mismo signo
                                             -Glicina y prolina

                                                                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Giros o codos β




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Giros o codos β




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Giros o codos β




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Giros o codos β




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Giros o codos β




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Aminoácidos




                        Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Estructuras supersecundarias




    Unidades βαβ      Meandro β    Unidades αα       Barril β              Llave Griega



                                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Estructuras supersecundarias




                                    Staphylococcus aureus

                                   Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Secundaria
    Estructuras supersecundarias




                 Dedos de Zinc     Cremalleras de Leucina


                                     Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales




Niveles de Organización de las
          Proteínas




                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria




                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria




                       Lisozima
                                  Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria




                          Chymotrypsin inhibitor 2



                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria




                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
 Tipo                      Interacción                     Definición
                                            Interacción electroestática entre grupos con
                               Iónica
                                                               carga
  N Covalentes (Débiles)




                                              Repulsión de las cadenas laterales de los
                            Hidrofóbica     aminoácidos hidrofóbicos al contacto con el
                                             agua debido a su índice de hidrofobicidad

                             Puentes de     Interacción entre un Hidrógeno de un átomo
                             hidrógeno      electronegativo y otro átomo electronegativo

                                            Atracción o repulsión de dipolos producidos
                           Fuerzas de Van
                                             por fluctuaciones en la densidad de carga
                             der Walls
                                                     electrónica de dos átomos

                             Puentes de     Oxidación y unión covalente de dos cisteínas
  C




                             disulfuros                     → Cistina

                                                                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria



                                   Segmentos al azar

              Hélices α                                          Láminas β

          Pliegues
                               Espontáneo                                 Lazos
                                y Rápido
                          Bucles                  Giros o codos β



                                                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Dominios

 “Región compacta, estable, de una cadena polipeptídica, que en ciertos casos, tienen
             funciones específicas separadas del resto de la proteína”




                                                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Depende de las condiciones del medio




                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Depende de las condiciones del medio
             Factores físicos              Factores químicos
                                                      Disolventes Orgánicos




                                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas

          Estado                                       Estado
         Desplegado                                    Nativo
          -Mayor Entropía-                         -Menor Entropía-



                                                      Agua +
           Agua Pura
                                                      Proteína
          -Menor Entropía-                          -Mayor Entropía-


                                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas



             Levinthal's
              Paradox



                                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas




                                                    Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares

                           Chaperonas moleculares
                Hsp40               Heat Shok Protein 40kD (DnaJ en E. coli)
                Hsp60              Heat Shok Protein 60kD (GroEL en E. coli)
                Hsp70              Heat Shok Protein 70kD (DnaK en E. coli)
                 BiP                    Binding Immunoglobulin Protein
                Hsp90              Heat Shok Protein 90kD (HtpG en E. coli)
               Hsp100           Heat Shok Protein 100kD (familia ClpB en E. coli)
                 PDI                      Proteína disulfuro isomerasa
                 PPI                    Péptido prolil cis-trans isomerasa



                                                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Proteínas Auxiliares




                           Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Plegamiento incorrecto




          Encefalopatía Espongiforme
        Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob
             Insomnio familiar fatal
                     Kuru
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Plegamiento incorrecto




          Encefalopatía Espongiforme
        Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob
             Insomnio familiar fatal
                     Kuru
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Plegamiento incorrecto




          Encefalopatía Espongiforme
        Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob
             Insomnio familiar fatal
                     Kuru
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Plegamiento incorrecto




          Encefalopatía Espongiforme
        Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob
             Insomnio familiar fatal
                     Kuru
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Terciaria
    Plegamiento incorrecto




          Encefalopatía Espongiforme         Diabetes del Tipo II
        Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob   Enfermedad de Alzheimer
             Insomnio familiar fatal      Enfermedad de Huntington
                     Kuru                  Enfermedad de Parkinson
                                          Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales




Niveles de Organización de las
          Proteínas




                                 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria




                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria




                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria
    Ventajas




      α                  β   α                      β
                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria
    Ventajas




      α                  β   α                      β
                             Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria
    Cooperatividad




                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Niveles estructurales
Estructura Cuaternaria
    Alosterismo




                         Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Esquema
Proteínas


      Características                     Niveles
       Generales                        Estructurales


                                                         Estructura de
                        Clasificación                  algunas proteínas
                                                        de importancia
                                                           biológica
                                                Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Proteínas de Importancia Biológica
  Fibrosas                                 Según su estructura
                                            Globulares
  Colágeno                                 Citocromo C
                                              Lisozima
 α-Queratina
                                           Ribonucleasa
 β-Queratina
                                            Mioglobina
  Elastina                                Hemoglobina


  Fibrosas     Proteínas Plasmáticas        Globulares

                                       Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos
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Estructura de proteínas y aminoácidos

  • 1. Unidad I ALL YOU NEED TO KNOW BY BR. CARLOS PEDROZA
  • 2. Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela “José María Vargas” Cátedra de Bioquímica PROTEÍNAS y AMINOÁCIDOS Estructura y Propiedades Br. Carlos Pedroza Unidad I
  • 3. Estructura de Proteínas y Aminoácidos ALL YOU NEED TO KNOW BY BR. CARLOS PEDROZA
  • 4. Esquema Métodos de Aminoácidos Proteínas Separación Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 5. Esquema Métodos de Aminoácidos Proteínas Separación Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 6. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 7. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 8. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Pro Pro Met Pro Gly Lys Ala Ala Gly Ser Cys Phe Gln Arg Pro Tyr Pro Pro Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 9. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Transportadores de NH3 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 10. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Transportadores de NH3 Intermediarios Metabólicos Arginina Ciclo de la Citrulina Urea Ornitina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 11. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Transportadores de NH3 Intermediarios Metabólicos Precursores Glucosa Hemo Cetoácidos Nucleótidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 12. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Transportadores de NH3 Intermediarios Metabólicos Precursores Neurotransmisores Glutamato Aspartato Glicina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 13. Importancia Biológica Péptidos – Proteínas Transportadores de NH3 Intermediarios Metabólicos Precursores Neurotransmisores Fosfolípidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 14. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 15. Estructura General Hidrógeno Cadena Lateral Varía en estructura, tamaño y carga eléctrica Influyen en su solubilidad en agua Grupo amino Grupo carboxilo Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 16. Estructura General 1.- Carbono 2.- Grupo Amino 3.- Grupo Carboxilo 4.- Hidrógeno 5.- Cadena Lateral Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 17. Características Generales Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 18. Características Generales Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 19. Características Generales His Val Met Ile 300 20 Gly Tyr Ala Leu Glu Trp Arg Lys Aminoácidos Aminoácidos Gln Thr Asn Phe Cys Ser Asp Pro Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 20. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 21. Isómeros “Moléculas con la misma fórmula molecular pero con distinta fórmula estructural o con diferente disposición espacial” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 22. Isómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 23. Isómeros COO- COO- CH CH CH HC COO- COO- Maleato (Cis) Fumarato (Trans) Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 24. Isómeros H COO- -OOC H C C C C H COO- H COO- Maleato (Cis) Fumarato (Trans) C4H2O4 C4H2O4 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 25. Isomería Estructural Espacial “Presentan los mismos “Presentan los mismos átomos pero enlazados átomos y difieren en el covalentemente con orden en que se enlazan a diferente orientación la molécula” espacial” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 26. Isomería Estructural Espacial De cadena Conformacional De posición Eclipsada Alternada De función Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 27. Isomería Estructural Espacial De cadena Conformacional De posición Eclipsada Alternada De función Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 28. Isomería Estructural De cadena De posición De función Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 29. Isomería Estructural CH3 CH2 CH2 CH3 De cadena Butano C4H10 De posición De función CH3 CH3 CH CH3 = Fórmula molecular ≠Representación de la cadena Metil-propano C4H10 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 30. Isomería Estructural OH De cadena CH2 CH2 CH3 De posición 1-Propanol C3H8O De función OH = Fórmula molecular CH3 CH CH3 ≠Posición del grupo funcional 2-Propanol C3H8O Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 31. Isomería Estructural Interconversiones De cadena Cicloalcanos ↔ Alquenos De posición Cicloalquenos ↔ Alquinos Aldehído ↔ Cetona De función Alcohol ↔ Éter Ácido carboxílico ↔ Éster = Fórmula molecular ≠ Tipo de compuesto Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 32. Isomería Estructural De cadena De posición De función = Fórmula molecular D-Gliceraldehído Dihidroxiacetona ≠ Tipo de compuesto Aldosa Cetosa C3H6O3 C3H6O3 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 33. Isomería Estructural CH3 CH2 OH De cadena Etanol C2H6O De posición De función CH3 O CH3 = Fórmula molecular Dimetil éter ≠ Tipo de compuesto C2H6O Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 34. Isomería Estructural Espacial De cadena Conformacional De posición Eclipsada Alternada De función Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 35. Isomería Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 36. Isomería Espacial “Tipo de disposición espacial de ciertos grupos químicos, Conformacional por rotación alrededor de un Eclipsada enlace simple. Alternada Configuracional Su interconversión NO Geométrica (Trans y Cis) requiere de ruptura de enlaces Óptica → Carbono quiral covalentes” Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 37. Isomería Vista Lateral Espacial Representación en caballete Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Etano Dextrorrotatorios y Levorrotatorios C2H6 Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 38. Isomería Proyección de Newman Espacial Disposición Eclipsada Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Etano Dextrorrotatorios y Levorrotatorios C2H6 Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 39. Isomería Proyección de Newman Espacial Disposición Alternada Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Etano Enantiómeros y Diasteroisómeros C2H6 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 40. Isomería “Los cambios Espacial conformacionales buscan la Conformacional disposición de menor energía Eclipsada libre de Gibbs. Alternada Permiten a las biomoléculas (como las proteínas) plegarse Configuracional hasta alcanzar la Geométrica (Trans y Cis) conformación más estable (de Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios menor energía libre)” Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 41. Isomería Espacial “Tipo de disposición espacial de ciertos grupos químicos, Conformacional alrededor de un doble enlace o Eclipsada de un carbono quiral. Alternada Configuracional Su interconversión requiere Geométrica (Trans y Cis) de ruptura de enlaces Óptica → Carbono quiral covalentes” Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 42. Isomería Espacial -OOC H H COO- Conformacional C C Eclipsada C C Alternada Configuracional H COO- H COO- Geométrica (Trans y Cis) Fumarato (Trans) Maleato (Cis) Óptica → Carbono quiral C4H2O4 C4H2O4 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 43. Isomería Espacial Conformacional H O C Eclipsada Alternada H C OH Configuracional CH3 Geométrica (Trans y Cis) 2-Hidroxi-Propanal Óptica → Carbono quiral C3H6O2 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 44. Isomería Carbono Espacial asimétrico Conformacional Eclipsada “Es aquel carbono Alternada unido, por enlaces Configuracional simples, a cuatro Geométrica (Trans y Cis) grupos sustituyentes Óptica → Carbono quiral diferentes entre sí” Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 45. Isomería Espacial Conformacional H O C Eclipsada Alternada H C OH Configuracional CH3 Geométrica (Trans y Cis) 2-Hidroxi-Propanal Óptica → Carbono quiral C3H6O2 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 46. Isomería Espacial Conformacional H O C Eclipsada Alternada H C OH Configuracional CH3 Geométrica (Trans y Cis) 2-Hidroxi-Propanal Óptica → Carbono quiral C3H6O2 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 47. Isomería Espacial Conformacional H O C Eclipsada Alternada H C OH Configuracional CH3 Geométrica (Trans y Cis) 2-Hidroxi-Propanal Óptica → Carbono quiral C3H6O2 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 48. Isomería “Existen moléculas que Espacial coinciden en todas sus Conformacional propiedades excepto en Eclipsada su capacidad de desviar Alternada el plano de luz polarizada. Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Son los llamados Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Isómeros ópticos”. Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 49. Isomería Isómeros Ópticos del Ácido Láctico Nombre Ácido (+) láctico Ácido (-) láctico Espacial Conformacional Estructura Eclipsada Punto de fusión 26oC 26oC Alternada Densidad (25o) 1,248 1,248 Solubilidad en agua ∞ ∞ Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Solubilidad en alcohol ∞ ∞ Óptica → Carbono quiral pKa 3,86 3,86 Dextrorrotatorios y Levorrotatorios [ ]D25 +3,8 -3,8 Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 50. Isomería Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 51. Isomería Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Espacial Conformacional Fuente de luz Luz no Filtro Tubo de muestraEclipsada Filtro blanca polarizada polarizador polarizador Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Plano de luz Dextrorrotatorios y Levorrotatorios polarizada Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 52. Isomería Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 53. Isomería Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Espacial Levorrotatorio (l) ó (-) Conformacional Dextrorrotatorio Eclipsada (d) ó (+) Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 54. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada ¿Por qué sucede Alternada Configuracional esto? Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 55. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Plano de Simetría Eclipsada “El que divide una figura o un Alternada cuerpo en dos partes iguales, de Configuracional tal modo que cada una de ellas Geométrica (Trans y Cis) es la imagen especular de la Óptica → Carbono quiral otra” Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 56. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 57. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 58. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 59. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 60. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 61. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Isómeros ópticos, Conformacional Enantiómeros o Eclipsada Enantiomorfos Alternada “Aquellos compuestos que Configuracional carecen de plano de simetría y Geométrica (Trans y Cis) que son simétricos entre sí o Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios imágenes especulares entre sí” Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 62. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional ¿Y si hay más Eclipsada Alternada de un carbono Configuracional asimétrico? Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 63. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Eclipsada Número de = 2 n Alternada Configuracional estereoisómeros Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral n → Número de carbonos asimétricos Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 64. Isomería Enantiómeros Diasteroisómeros Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial CH3 CH3 CHConformacional 3 3 CH Eclipsada X C H H C X X C H H C X Alternada Y C H H C Y H C Y Y C H Configuracional CH3 CH3 CH3Geométrica (Trans y Cis) CH3 Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 65. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Enantiómero Isómeros espaciales que son Eclipsada imágenes especulares entre sí Alternada Diasteroisómero Configuracional Isómeros espaciales que NO son imágenes especulares entre sí Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 66. Isomería Enantiómeros y Diasteroisómeros Espacial Conformacional Iguales características Eclipsada Enantiómeros físicas y químicas Alternada Diferentes Diasteroisómeros características físicas y Configuracional químicas Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 67. Isomería Nomenclatura de los Isómeros Ópticos Espacial Cuando sólo hay un Conformacional carbono asimétrico Eclipsada Nomenclatura D-L Alternada Proyección de Fischer. Configuracional Cuando hay uno o más Geométrica (Trans y Cis) carbonos asimétricos Óptica → Carbono quiral Nomenclatura R-S Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Convención CIP Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 68. Isomería Espacial 1º.- La cadena carbonada se sitúa en Conformacional vertical, con las valencias que la integran en dirección a la parte posterior del plano. Eclipsada 2º.- La cadena se orienta con la parte Alternada más oxidada hacia arriba y la más reducida hacia abajo. Configuracional 3º.- Las valencias que no integran la Geométrica (Trans y Cis) cadena carbonada resultan horizontales y Óptica → Carbono quiral dirigidas hacia la parte anterior del plano. Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 69. Isomería Espacial 1º.- La cadena carbonada se sitúa en Conformacional vertical, con las valencias que la integran en dirección a la parte posterior del plano. Eclipsada 2º.- La cadena se orienta con la parte Alternada más oxidada hacia arriba y la más reducida hacia abajo. Configuracional 3º.- Las valencias que no integran la Geométrica (Trans y Cis) cadena carbonada resultan horizontales y Óptica → Carbono quiral dirigidas hacia la parte anterior del plano. Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 70. Isomería Espacial 1º.- La cadena carbonada se sitúa en Conformacional vertical, con las valencias que la integran en dirección a la parte posterior del plano. Eclipsada 2º.- La cadena se orienta con la parte Alternada más oxidada hacia arriba y la más reducida hacia abajo. Configuracional 3º.- Las valencias que no integran la Geométrica (Trans y Cis) cadena carbonada resultan horizontales y Óptica → Carbono quiral dirigidas hacia la parte anterior del plano. Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 71. Isomería ¡Ten cuidado! Nomenclatura de los Isómeros Ópticos Espacial Conformacional ¡Nomenclatura D-L ≠ Rotación específica (+) (-)! Eclipsada Alternada Configuracional Geométrica (Trans y Cis) Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 72. Isomería Nomenclatura de los Isómeros Ópticos Espacial ¡Recuerda siempre! Conformacional Eclipsada Todos los aminoácidos que constituyen a las Alternada proteínas son: Configuracional Geométrica (Trans y Cis) -aminoácidos L-aminoácidos Óptica → Carbono quiral Dextrorrotatorios y Levorrotatorios Enantiómeros y Diasteroisómeros Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 73. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 74. Abreviaciones Alanine Ala A Glycine Gly G Proline Pro P Arginine Arg R Histidine His H Serine Ser S Asparagine Asn N Isoleucine Ile I Threonine Thr T Aspartic Acid Asp D Leucine Leu L Tryptophan Trp W Cysteine Cys C Lysine Lys K Tyrosine Tyr Y Glutamine Gln Q Methionine Met M Valine Val V Glutamic Acid Glu E Phenylalanine Phe F Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 75. Clasificación Esencial No Esencial Arginine Alanine Histidine Asparagine Isoleucine Aspartate Leucine Cysteine Lysine Glutamate Methionine Glutamine Phenylalanine Glycine Threonine Proline Tryptophan Serine Valine Tyrosine Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 76. Clasificación Alifáticos Sin Carga - No polares - Aromáticos - Polares - Glycine - No polares - Serine Alanine Phenylalanine Threonine Proline Tyrosine Cysteine Valine Tryptophan Asparagine Leucine Glutamine Isoleucine Methionine Carga Negativa Carga Positiva - Ácidos - - Básicos - Aspartato Lysine Glutamato Histidine Arginine Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 77. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 78. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 79. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 80. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 81. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 82. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 83. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 84. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 85. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 86. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 87. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 88. Clasificación de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 89. Aminoácidos no comunes Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 90. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 91. Ionización de los Aminoácidos COOH COO- COO- +H C H +H C H C H 3N 3N H2N R R R Zwitterión Anfótero “Molécula eléctricamente neutra, pero que presenta cargas “Se dice de las moléculas parciales positivas y negativas que pueden reaccionar en átomos diferentes de su como ácido o como base”. estructura” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 92. Ionización de los Aminoácidos COOH COO- COO- +H C H +H C H C H 3N 3N H2N R R R Forma no iónica Zwitterión Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 93. Ionización de los Aminoácidos 2 7 12 Ácido Base ↑[H+] → ↑[Formas protonadas] ↓[H+] → ↑[Formas no protonadas] pH = -log[H+] Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 94. Ionización de los Aminoácidos 2 7 12 Ácido Base ↑[H+] → ↑[Formas protonadas] ↓[H+] → ↑[Formas no protonadas] pH = -log[H+] Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 95. Ionización de los Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 96. Ionización de los Aminoácidos pKa del Grupo Carboxilo COO- [COOH] =[COO-] pKa del Grupo Amino +H N C H [NH3+]=[NH2] 3 pKa del Grupo R Aminoácidos [COOH] =[COO-] R Básicos (lisina, histidina y arginina), Ácidos [NH3+]=[NH2] (aspartato y glutamato) y [OH] = [O-] Tirosina y Cisteína [SH] = [S-] Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 97. Ionización de los Aminoácidos COOH COO- COO- +H +H +H 3N C H 3N C H 3N C H R R R R-NH3 α-COOH R-COOH α-NH3 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 98. Ionización de los Aminoácidos α-COOH α-NH3+ Side COO- group group Chain +H N C H 3 R Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 99. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 100. Curva de titulación de los Aminoácidos pH = pKa + log[Forma desprotonada] [Forma protonada] [Forma desprotonadapKaForma protonada] ]=[ pH donde el ácido está parcialmente disociado pH = pK [Forma desprotonada]=[Forma protonada] Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 101. Curva de titulación de los Aminoácidos Ecuación de Henderson-Hasselbach Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 102. Curva de titulación de los Aminoácidos Ecuación de Henderson-Hasselbach Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 103. Curva de titulación de los Aminoácidos COOH COO- COO- +H +H +H 3N C H 3N C H 3N C H R R R R-NH3 α-COOH R-COOH α-NH3 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 104. Curva de titulación de los Aminoácidos Punto isoeléctrico Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 105. Curva de titulación de los Aminoácidos Punto isoeléctrico Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 106. Curva de titulación de los Aminoácidos Punto isoeléctrico pK (1)  pK (1) pI  2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 107. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,34 pK2 →9,60 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 108. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,34 pI  pK1  pK 2 pK2 →9,60 2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 109. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,34 pI  pK1  pK 2  5,97 pK2 →9,60 2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 110. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,34 pK2 →9,60 pI → 5,97 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 111. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,19 pKR →4,25 pK2 →9,67 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 112. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,19 pK1  pK R pKR →4,25 pI  2 pK2 →9,67 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 113. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,19 pK1  pK R pKR →4,25 pI   3,22 2 pK2 →9,67 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 114. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 2,19 pKR →4,25 pK2 →9,67 pI → 3,22 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 115. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 1,82 pKR →6,00 pK2 →9,17 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 116. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 1,82 pK R  pK 2 pKR →6,00 pI  2 pK2 →9,17 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 117. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 1,82 pK R  pK 2 pKR →6,00 pI   7,58 2 pK2 →9,17 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 118. Curva de titulación de los Aminoácidos pK1 → 1,82 pKR →6,00 pK2 →9,17 pI → 7,58 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 119. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 120. Índice de Hidrofobicidad Hidrofílico Hidrofóbico -3 -2 -1 0 1 2 3 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 121. Esquema Aminoácidos Nomenclatura, Importancia Estructura Esteroisomería clasificación y Biológica general abreviaciones Curva de Ionización de Enlace Índice de titulación de los los peptídico Hidrofobicidad Aminoácidos Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 122. Enlace Peptídico Reacción de Condensación “Reacción orgánica en la cual dos moléculas se combinan con eliminación de moléculas de agua” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 123. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 124. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 125. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 126. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar 4. Conformación Trans Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 127. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar 4. Conformación Trans 5. Rígida Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 128. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar 4. Conformación Trans 5. Rígida 6. Más corto Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 129. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar 4. Conformación Trans 5. Rígida 6. Más corto 7. Puentes de H2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 130. Enlace Peptídico Características 1. Tipo Amida 2. Posee “resonancia” 3. Carácter Polar 4. Conformación Trans 5. Rígida 6. Más corto 7. Puentes de H2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 131. Enlace Peptídico Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 132. Esquema Métodos de Aminoácidos Proteínas Separación Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 133. Esquema Proteínas Características Niveles Generales Estructurales Estructura de Clasificación algunas proteínas de importancia biológica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 134. Esquema Proteínas Características Niveles Generales Estructurales Estructura de Clasificación algunas proteínas de importancia biológica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 135. Características Generales Oligopéptidos (<15 aa) Polipéptidos (15-100 aa) Proteínas (>100 aa) Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 136. Características Generales Vasopresina Glutation Troponina C Insulina GramicidinaS Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 137. Características Generales Algunas funciones de las proteínas Enzimas [...] Transporte Hemoglobina, lipoproteínas Nutrientes Ovoalbúmina, caseína De Reserva Ferritina Contráctiles Actina, miosina, tubulina Estructurales Colágeno, queratinas Defensa Ig, trombina, veneno de serpientes Reguladoras Hormonas Otras funciones Anticongelantes, monelina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 138. Características Generales Constituyentes 5.000 → 1.000.000 H, C, N, D, S Daltons (Zn, Fe, Cu, P) Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 139. Características Generales “Una secuencia primaria sólo puede adoptar una (o muy pocas) conformaciones en el espacio” Mayor estabilidad → Mínima cantidad de energía libre (G) Restricción de movimiento del enlace peptídico Características de los grupos R Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 140. Propiedades Solubilidad Especificidad Capacidad Amortiguadora Presión Coloidosmótica o Presión Oncótica Precipitación Selectiva Desnaturalización y Renaturalización Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 141. Propiedades Desnaturalización y Renaturalización Proteína Desnaturalización Proteína Desnaturalizada Renaturalización Nativa Proteína Desnaturalizada ↔ Proteína Nativa Irregular, variable, abierta Regular compacta Ausencia de estructura secundaria Presencia de estructura secundaria Pocos enlaces intramoleculares Abundancia de enlaces intramoleculares Residuos hidrofóbicos expuestos Residuos hidrofóbicos no expuestos Enlaces disulfuros reducidos Enlaces disulfuros oxidados Catalíticamente inactivos Catalíticamente activos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 142. Esquema Proteínas Características Niveles Generales Estructurales Estructura de Clasificación algunas proteínas de importancia biológica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 143. Clasificación Según su composición Según el número de subunidades Según su estructura Según su función Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 144. Clasificación Según su composición Simples Conjugadas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 145. Clasificación Según su composición Clase Grupo prostético Ejemplo Lipoproteína Lípidos [...] Glucoproteína Glúcidos Inmunoglobulina G Fosfoproteína Grupos fosfatos Caseína de la leche Hemoproteína Hemo (ferroporfirina) Hemoglobina Flavoproteína Nucleótidos de flavina Succinato deshidrogenasa Hierro Ferritina Zinc Alcohol deshidrogenasa Metaloproteínas Calcio Calmodulina Molibdeno Dinitrogenasa Cobre Plastocianina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 146. Clasificación Según el número de subunidades Monomérica Multimérica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 147. Clasificación Según su estructura Fibrosas Globulares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 148. Clasificación Según su función Estructurales Dinámicas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 149. Esquema Proteínas Características Niveles Generales Estructurales Estructura de Clasificación algunas proteínas de importancia biológica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 150. Niveles estructurales Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 151. Niveles estructurales Niveles de Organización de las Proteínas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 152. Niveles estructurales Estructura Primaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 153. Niveles estructurales Estructura Primaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 154. Niveles estructurales Estructura Primaria La estructura primaria determina la estructura secundaria, terciaria (y cuaternaria) de las proteínas Se encuentran en la región interna de las proteínas o interaccionando con alguna otra Hidrófobos región hidrofóbica, evitando el contacto con el agua→ Cremalleras de leucina, bolsillos (Alifáticos y Aromáticos) hidrófobos, alfa hélices hidrófobas. Tirosina y el triptófano. Polares Se ubican en la superficie proteica en contacto con el agua, iones y otras moléculas (Sin carga, ácidos y básicos) polares. Posibilitan la solubilidad de la proteína en el medio acuoso. Puede oxidarse para formar puentes disulfuro (-S-S-) con una segunda cisteína ubicada Cisteína en la misma cadena polipepídica o en una cadena diferente → Mayor estabilidad. Puede ubicarse en lugares muy estrechos dentro de la proteína o ser un factor Glicina desestabilizante debido a que permite una mayor libertad de movimiento Permite cambios bruscos en la dirección de la cadena polipeptídica y limita la Prolina posibilidad de movimiento aleatorio de la cadena. Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 155. Niveles estructurales Estructura Primaria 1 A A S X D X S L V E V H X X V F I V P P X I L Q A V V S I A 31 T T R X D D X D S A A A S I P M V P G W V L K Q V X G S Q A 61 G S F L A I V M G G G D L E V I L I X L A G Y Q E S S I X A 91 S R S L A A S M X T T A I P S D L W G N X A X S N A A F S S 121 X E F S S X A G S V P L G F T F X E A G A K E X V I K G Q I 151 T X Q A X A F S L A X L X K L I S A M X N A X F P A G D X X 181 X X V A D I X D S H G I L X X V N Y T D A X I K M G I I F G 211 S G V N A A Y W C D S T X I A D A A D A G X X G G A G X M X 241 V C C X Q D S F R K A F P S L P Q I X Y X X T L N X X S P X 271 A X K T F E K N S X A K N X G Q S L R D V L M X Y K X X G Q 301 X H X X X A X D F X A A N V E N S S Y P A K I Q K L P H F D 331 L R X X X D L F X G D Q G I A X K T X M K X V V R R X L F L 361 I A A Y A F R L V V C X I X A I C Q K K G Y S S G H I A A X Saccharomyces cerevisiae 391 G S X R D Y S G F S X N S A T X N X N I Y G W P Q S A X X S 421 K P I X I T P A I D G E G A A X X V I X S I A S S Q X X X A 451 X X S A X X A Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 156. Niveles estructurales Estructura Primaria Nº de posibilidades de secuencias Tripéptido 3! 6 secuencias Péptido de 20aa 20! 2,43 x 1018 secuencias Péptido de 60aa 60! 8,32 x 1081 secuencias 1 Met Asn Leu 2 Met Leu Asn 3 Asn Leu Met 4 Asn Met Leu 5 Leu Asn Met 6 Leu Met Asn Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 157. Niveles estructurales Estructura Primaria Nº de posibilidades de secuencias Tripéptido 3! 6 secuencias Péptido de 20aa 20! 2,43 x 1018 secuencias Péptido de 60aa 60! 8,32 x 1081 secuencias Patologías por alteración de la estructura primaria Anemia falciforme Hemoglobina Hipercolesterolemia Receptor LDL Porfirias Enzimas del metabolismo del hemo Síndrome Lesh-Nyham Hipoxantina fosforribosil transferasa Gota Xantina oxidasa Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 158. Niveles estructurales Niveles de Organización de las Proteínas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 159. Niveles estructurales Estructura Secundaria “Arreglo espacial de los residuos Hélice α de AA adyacentes en una cadena Laminas β polipeptídica que se repite de Giros β forma regular dando origen a una Estructuras estructura periódica” supersecundarias Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 160. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 161. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 162. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 163. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 164. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 165. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α Estabiliza Desestabilizan 1. Puentes de hidrógeno intracatenarios paralelos al eje 1. Grupos R voluminosos entre el oxígeno carbonilo y el 2. Secuencias con densidad de hidrógeno de la amida del cuarto carga del mismo signo residuo 3. Glicina y prolina 2. Aminoácidos polares 3. Interacciones de van der Waals Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 166. Niveles estructurales Estructura Secundaria Lámina u hoja β plegada Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 167. Niveles estructurales Estructura Secundaria Lámina u hoja β plegada Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 168. Niveles estructurales Estructura Secundaria Lámina u hoja β plegada Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 169. Niveles estructurales Estructura Secundaria Lámina u hoja β plegada Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 170. Niveles estructurales Estructura Secundaria Lámina u hoja β plegada Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 171. Niveles estructurales Estructura Secundaria Hélice α y Lámina u hoja β plegada Características Hélice α Lámina u hoja β plegada Forma Hélice Cadena extendida o zig-zag Disposición de las cadenas Hacia el exterior Alternados laterales Enlaces de hidrógeno Intracatenarios (cada 4 aminoácidos) Intercatenarios -Puentes de hidrógeno Fuerzas que la estabilizan -Aminoácidos polares -Grupos R pequeños -Interacciones de van der Waals -Grupos R voluminosos -Grupos R voluminosos -Secuencias con densidad de carga del Fuerzas que la desestabilizan -Secuencias con densidad de carga del mismo signo mismo signo -Glicina y prolina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 172. Niveles estructurales Estructura Secundaria Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 173. Niveles estructurales Estructura Secundaria Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 174. Niveles estructurales Estructura Secundaria Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 175. Niveles estructurales Estructura Secundaria Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 176. Niveles estructurales Estructura Secundaria Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 177. Niveles estructurales Estructura Secundaria Aminoácidos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 178. Niveles estructurales Estructura Secundaria Estructuras supersecundarias Unidades βαβ Meandro β Unidades αα Barril β Llave Griega Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 179. Niveles estructurales Estructura Secundaria Estructuras supersecundarias Staphylococcus aureus Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 180. Niveles estructurales Estructura Secundaria Estructuras supersecundarias Dedos de Zinc Cremalleras de Leucina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 181. Niveles estructurales Niveles de Organización de las Proteínas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 182. Niveles estructurales Estructura Terciaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 183. Niveles estructurales Estructura Terciaria Lisozima Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 184. Niveles estructurales Estructura Terciaria Chymotrypsin inhibitor 2 Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 185. Niveles estructurales Estructura Terciaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 186. Niveles estructurales Estructura Terciaria Tipo Interacción Definición Interacción electroestática entre grupos con Iónica carga N Covalentes (Débiles) Repulsión de las cadenas laterales de los Hidrofóbica aminoácidos hidrofóbicos al contacto con el agua debido a su índice de hidrofobicidad Puentes de Interacción entre un Hidrógeno de un átomo hidrógeno electronegativo y otro átomo electronegativo Atracción o repulsión de dipolos producidos Fuerzas de Van por fluctuaciones en la densidad de carga der Walls electrónica de dos átomos Puentes de Oxidación y unión covalente de dos cisteínas C disulfuros → Cistina Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 187. Niveles estructurales Estructura Terciaria Segmentos al azar Hélices α Láminas β Pliegues Espontáneo Lazos y Rápido Bucles Giros o codos β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 188. Niveles estructurales Estructura Terciaria Dominios “Región compacta, estable, de una cadena polipeptídica, que en ciertos casos, tienen funciones específicas separadas del resto de la proteína” Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 189. Niveles estructurales Estructura Terciaria Depende de las condiciones del medio Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 190. Niveles estructurales Estructura Terciaria Depende de las condiciones del medio Factores físicos Factores químicos Disolventes Orgánicos Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 191. Niveles estructurales Estructura Terciaria Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas Estado Estado Desplegado Nativo -Mayor Entropía- -Menor Entropía- Agua + Agua Pura Proteína -Menor Entropía- -Mayor Entropía- Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 192. Niveles estructurales Estructura Terciaria Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas Levinthal's Paradox Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 193. Niveles estructurales Estructura Terciaria Termodinámicamente favorecido → es guiado por fuerzas entrópicas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 194. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Chaperonas moleculares Hsp40 Heat Shok Protein 40kD (DnaJ en E. coli) Hsp60 Heat Shok Protein 60kD (GroEL en E. coli) Hsp70 Heat Shok Protein 70kD (DnaK en E. coli) BiP Binding Immunoglobulin Protein Hsp90 Heat Shok Protein 90kD (HtpG en E. coli) Hsp100 Heat Shok Protein 100kD (familia ClpB en E. coli) PDI Proteína disulfuro isomerasa PPI Péptido prolil cis-trans isomerasa Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 195. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 196. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 197. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 198. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 199. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 200. Niveles estructurales Estructura Terciaria Proteínas Auxiliares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 201. Niveles estructurales Estructura Terciaria Plegamiento incorrecto Encefalopatía Espongiforme Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob Insomnio familiar fatal Kuru Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 202. Niveles estructurales Estructura Terciaria Plegamiento incorrecto Encefalopatía Espongiforme Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob Insomnio familiar fatal Kuru Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 203. Niveles estructurales Estructura Terciaria Plegamiento incorrecto Encefalopatía Espongiforme Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob Insomnio familiar fatal Kuru Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 204. Niveles estructurales Estructura Terciaria Plegamiento incorrecto Encefalopatía Espongiforme Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob Insomnio familiar fatal Kuru Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 205. Niveles estructurales Estructura Terciaria Plegamiento incorrecto Encefalopatía Espongiforme Diabetes del Tipo II Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob Enfermedad de Alzheimer Insomnio familiar fatal Enfermedad de Huntington Kuru Enfermedad de Parkinson Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 206. Niveles estructurales Niveles de Organización de las Proteínas Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 207. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 208. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 209. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Ventajas α β α β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 210. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Ventajas α β α β Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 211. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Cooperatividad Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 212. Niveles estructurales Estructura Cuaternaria Alosterismo Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 213. Esquema Proteínas Características Niveles Generales Estructurales Estructura de Clasificación algunas proteínas de importancia biológica Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza
  • 214. Proteínas de Importancia Biológica Fibrosas Según su estructura Globulares Colágeno Citocromo C Lisozima α-Queratina Ribonucleasa β-Queratina Mioglobina Elastina Hemoglobina Fibrosas Proteínas Plasmáticas Globulares Material elaborado por el Br. Carlos Pedroza