1. SCOP - Structural Classification
Of Proteins
• Организована в соответствии со
структурными семействами белков.
• Иерархическая система.

2. NCBI - Entrez
• Entrez - поисковая машина для баз NCBI.
• Поиск начинается с выбора адекватной области для
поикса (Nucleotide, белки).
• Можно использовать определители полей, логические
операторы, условия и т.д.

3. NCBI - Entrez
Ограничения:

4. SRS (Sequence Retrieval System).
• Исталлирована на множестве серверов.
• Имеет связи со многими базами данных.
• Предоставляет множество инструментов и служб для анализа.
• Позволяет сохранить результаты работы и анализа и
продолжить работу локально.

5. SRS
Рабочая среда
Выбор базы
данных
Заполнение
формы
запроса
Страница
результатов

6. Текстовый поиск
Общие принципы:
1. Все главные базы предоставляют удобные
средства для тектового поиска.
2. Поиск по ключевым словам или полям.
3. Одновременный поиск в нескольких базах.
4. Дополнительные условия (дата, длина и т.д.).

7. Эффективность поиска
Эффективность: время и адекватные результаты!

8. Проект ENCODE
http://genome.ucsc.edu/