Presentation supporting a practical session to identify which kind of data people are dealing with and useful information to digitize in priority. Includes group discussions and roleplays to familiarize with different kinds of data (collections, observations, sampling-event, taxonomic, possibly pictures) and how to best share the related information. --- Présentation utilisée dans une session pratique pour identifier les types de données avec lesquelles les participants travaillent, ainsi que les informations utiles à numériser en priorité. Cette session comprend des discussions de groupe et des jeux de rôle afin de se familiariser avec les différents types de données existants (collections, observations, données d’échantillonnage, données taxonomiques, données multimédia…) et de mieux partager les informations correspondantes.

1. 23 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Origins of data: examples and
illustrations Sophie Pamerlon

2. 23 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Origines des données :
exemples et illustrations
Sophie Pamerlon

3. Checklists and other
taxonomical resources

4. Référentiels
taxonomiques et autres
listes de taxons

5. Checklists and taxonomical resources
Taxon list of
reference: a valid
list of species/taxa
present in a given
area, with their
hierarchy and
synonyms
Red list (at
national, regional
or local level): a
list of taxa present
in a given area
with their
vulnerability status
Checklist: a simple
list of taxa present
in a given area

6. Référentiels et listes taxonomiques
Référentiel
taxonomique : liste
valide
d’espèces/taxons
présents dans une
région donnée, avec
leur hiérarchie et
synonymes
Liste rouge
(nationale, régionale
ou locale) : list de
taxons présents
dans une région
donnée avec leur
statut de
vulnérabilité
Checklist: une liste
simple de taxons
présents dans une
région donnée

7. Specimens and natural
history collection
materials

8. Spécimens et échantillons
issus de collections
d’histoire naturelle

9. Specimens and materials
Preserved
specimens in
formol, alcohol
(fishes, herpetology
collections…);
mounted
specimens (birds,
mammals, insects)
Fossils and other
paleontological
materials (amber,
teeth, bones…);
animal or vegetal
samples (DNA,
organs, skin, fur,
faeces…)
Herbarium sheets
and vegetal
materials (seeds,
foliage, branches,
bark,
dried/preserved
fruits…)

10. Spécimens et échantillons
Spécimens conservés
dans du formol, de
l’alcool (collections de
poissons,
d’herpétologie...) ;
spécimens montés
(oiseaux, mammifères,
insectes...)
Fossiles et autres
matériels
paléontologiques
(ambre, dents, os…) ;
échantillons animaux
ou végétaux (ADN,
organes, peaux,
fourrures, faeces…)
Planches d’herbier et
matériel végétal
(graines, feuilles,
branches, écorce,
fruits séchés ou
conservés…)

11. Literature

12. Littérature

13. Examples of literature documents
PhD or Master
thesis
Reports and other
written documents
Published or in
press scientific
articles

14. Exemples de documents de littérature
Thèses (PhD) et
rapports de Master
Rapports et autres
documents écrits
Articles
scientifiques
publiés ou sous
presse

15. Fieldwork records and
notes

16. Notes et enregistrements
de terrain

17. Fieldwork records and notes
Logs, field notes
with taxa observed
or collected; notes
about the protocol
used on the field
Citizen science
logs
Surveys,
assessments

18. Notes et enregistrements de terrain
Carnets de terrain,
fiches et listes de
taxons observés ou
collectés, notes sur
le(s) protocole(s)
utilisé(s) sur le
terrain
Données de
sciences
participatives
Enquêtes, études
d’impact

19. Other origins of data

20. Autres origines possibles
de données

21. Other origins of data
Paper maps or
atlas; prints of
satellite pictures
Other supports:
pictures, audio,
video recordings
Remote sensing
data: GPS, radar
or satellite data;
camera traps;

22. Autres origines possibles de données
Cartes papier et
atlas ; impressions
d’images satellites
Autres supports :
photos,
enregistrements
audio ou vidéo
Données
obtenues à
distance : GPS,
données radar ou
satellite, pièges
photo/caméra

23. Results of the pre-workshop
questionnaire (origins of data)

24. Résultats du questionnaire
pré-atelier (origines des
données)

25. Datasets managed by the training participants
(by origin of data)
Dataoriginsfromparticipants

26. Jeux de données gérés par les participants à
l’atelier (par origines de données)
riginesdesdonnéesdespartcipants

27. Datasets managed by the training participants
(by taxa)
Dataoriginsfromparticipants

28. Jeux de données gérés par les participants à
l’atelier (par taxons)
riginesdesdonnéesdespartcipants

29. Databases management and sharing (1 / 2)
Dataoriginsfromparticipants

30. Gestion et partage des bases de données (1 /
2)
Dataoriginsfromparticipants

31. Databases management and sharing (2 / 2)
Dataoriginsfromparticipants

32. Gestion et partage des bases de données (2 /
2)
Dataoriginsfromparticipants

33. Origins of data and
Darwin Core concepts

34. Origines de données et
concepts Darwin Core

35. Darwin Core standard: Cores and Extensions
DataoriginsandDarwinCore

36. Darwin Core : Coeurs de standard et Extensions
OriginesdedonnéesetDwC

37. Darwin Core standard: Cores and Extensions
DataoriginsandDarwinCore
Darwin Core standard = Core of standard + possible Extensions (star schema)
Different Cores can be used depending on the origin of the data:
- Occurrence Core for natural history collection specimens and field simple
observations
- Taxon Core for taxonomical lists (checklists, redlists)
- Event Core for sampling events (surveys, transects, quadrats, traps…)
Extensions are used for giving more details about the data:
- Simple Multimedia Extension for exchanging metadata about multimedia
resources, in particular links to image, video and audio files.
- Taxon Description to exchange simple text/paragraph based taxon
descriptions.
- Measurement or Facts to add information about biotic and abiotic variables
- Trait descriptor
- Material sample
- And many more!
NOTE: Some Cores can be used as extensions too, such as the Occurrence one
that can be used in addition to the Event Core.

38. Standard Darwin Core : Coeurs de standard
et extensions
OriginesdedonnéesetDwC
Standard Darwin Core = Coeur de standard + éventuelles Extensions (schéma en étoile)
Différents coeurs de standard peuvent être utilisés en fonction de l’origine des données :
- Coeur de standard Occurrence Core pour les collections d’Histoire Naturelle et les
observations simples de terrain
- Coeur de standard Taxon pour les listes taxonomiques (référentiels, listes rouges,...)
- Coeur de standard Événement (Event Core) pour les données d’échantillonnage
(relevés, transects, quadrats, pièges…)
Les Extensions sont utilisées afin de partager plus de détails sur les données :
- Simple Multimedia Extension pour échanger des métadonnées sur les ressources
multimédia associées aux données, notamment des fichiers image, audio ou vidéos
- Taxon Description pour échanger des descriptions de taxons sous forme de texte
simple.
- Measurement or Facts pour ajouter des informations sur des variables biotiques (taille,
couleur des fleurs…) ou abiotiques (pH, température de l’eau, hygrométrie…)
- Description de traits d’histoire de vie
- Material Sample pour décrire des échantillons (peau, os, ADN…)
- Et plus encore !
NOTE: Certains coeurs de standard peuvent être utilisés comme des Extensions, comme le
coeur de standard Occurrence qui peut être lié au coeur de standard Événement.

39. Occurrence core

40. Coeur de standard
Occurrences

41. Choose the Occurrence Core on the IPT
OccurrenceCore

42. Choisir le coeur de standard Occurrence sur l’IPT
OccurrenceCore

43. Mapping for Occurrence Data
OccurrenceCore

44. Mapping pour les données d’Occurrence
OccurrenceCore

45. Taxon Core

46. Coeur de standard Taxon

47. Choose the Taxon Core on the IPT
TaxonCore

48. Choisir le coeur de standard Taxon sur l’IPT
TaxonCore

49. Mapping for Taxonomic Data
TaxonCore

50. Mapping pour les données taxonomiques
TaxonCore

51. Event Core

52. Coeur de standard
Evénement
d’échantillonnage

53. Choose the Event Core on the IPT
EventCore

54. Choisir le coeur de standard Événement sur l’IPT
EventCore

55. Mapping for Event Core (Sampling Data)
EventCore

56. Mapping pour les données d’échantillonnage
EventCore

57. Darwin Core Extensions

58. Extensions du Darwin Core

59. Where to find the Extensions
DarwinCoreExtensions

60. Où trouver les Extensions
ExtensionsduDarwinCore

61. A few examples of existing Extensions
DarwinCoreExtensions

62. Quelques exemples d’Extensions disponibles
ExtensionsduDarwinCore

63. 23 August 2016
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illustrations Sophie Pamerlon

64. 23 AUGUST 2016
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