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Herança extranuclear em
    fungos e em leveduras
Profa. Dra. Adriana Dantas
UERGS – Bento Gonçalves, RS
Fungos
   eucariotos
   esporos
   não-fotossintéticos
   nutrição absortiva
   modos de reprodução
Tipos morfológicos básicos

 Leveduras     (Células arredondadas)
 Micélio (céls.filalmentosas septadas ou não)

 Fungos    dimórficos
Estrutura dos fungos
   Fungos filamentosos (bolores)

   Unidade estrutural = HIFA
       Septada ( dividem as hifas em unidades
        celulares uninucleadas)
       Cenocítica (nao contem septos, celulas longas
        e continuas com muitos nucleos)


   Conjunto de hifas = MICÉLIO
Comparação entre fungo e
 bactérias
                   Fungos               Bactérias
Tipo de célula     Eucariótica          Procariótica

Membrana celular   Esteróis presentes   Esteróis ausentes,
                                        com exceção do
                                        Mycoplasma
Parede celular     Glicanas, mananas,   peptideoglicana
                   quitina
Esporos            Produz uma grande    Endosporos (não
                   variedade de         para reproduçao)
                   esporos              alguns esporos
                   reprodutivos         assexuais
                   sexuais e            reprodutivos
                   assexuais
Metabolismo        Limitado a           Heterotrófico,
                   heterotrófico;       quimioautotrofico,
                   aeróbico,            fotoautotrofico,
                   anaeróbico           aeróbico,
                   facultativo          anaeróbico
                                        facultativo
Crescimento das Hifas
   Crescimento das hifas é por alongamento das
    extremidades
   Cada parte de uma hifa é capaz de crescer
   Fragmento quebrado, esse se alonga e foram uma
    nova hifa
   Em laboratório, os fungos crescem a partir de
    fragmentos obtidos de um talo de fungo
Tipos
   Hifas vegetativas – obtêm os
    nutrientes
   Hifas reprodutiva ou aérea
       Responsável pela reprodução
       Se projeta acima da superfície sobre o
        qual o fungo esta crescendo
       Sustentam os esporos reprodutivos
       As hifas crescem formam uma massa
        filamentosa chamada de micélio, visível
        a olho nú.
Hifas aéreas




Hifas
vegetativas
Aspergillus nidulans
Tipos de Esporos Assexuais




          Aspergillus
Cryptococcus neoformans
   Candida albicans
Rhyzopus
Aplicações dos fungos
   Fornecedores de químicos
    (antibióticos)
   Controle biológico
   Simbiontes mutualistas
   Parasitas
   Bebidas e alimentos
   Biodegradação
   Biotecnologia
Neurospora Poky
   1952 – Mary Mitchell isolou uma
    linhagem mutante de Neurospora
    que chamou de Poky
   Caracteristicas (difere do fungo selvagem)
       Crescimento lento
       Apresenta herança materna
       Quantidades anormais de cromossomos
Citocromo

   São proteínas mitocondriais
    transportadoras de elétrons
   Necessária a oxidação para gerar energia
    sob a forma de ATP
   Três tipos de citocromos:
       a, b e c
   Em Neurospora não há citocromo a ou b,
    há um excesso de citocromo c.
Herança materna



Poky    x selvagem   selvagem      x   Poky



                                Selvagem
       Poky
Organismo haplóide
   Genitor contribui com a maior parte do citoplasma para
    a prole

   Chamado genitor materno, mesmo que não exista
    reprodução sexual

   Nos cruzamentos poky x selvagem quaisquer genes
    nucleares que difiram entre as linhagens parentais
    segrega de modo mendeliano 1:1 na prole

   A Prole poky é transmitida por muitas gerações quando
    cruzado como fêmeas

   Poky tem localização extra nuclear (citoplasma)
Cruzamentos reciprocos de poky x
     Neurospora normal



   Genitor femea contribui
    com a maior parte do
    citoplasma para a prole;

   Locus nuclear alelos:
      ad+ e ad- (1:1)
Mutação poky
   Fenótipo mutante envolvem as
    mitocôndrias
   Crescimento lento – deficiência de ATP
   Tem quantidades anormais de citocromos
   David Luck experimento com marcação
    com colina radiotiva nas mitocôndrias,
    concluiu que mitocôndrias se propagam
    por multiplicação das mitocôndrias pré-
    existentes.
Teste do Heterocarion
   Usado para detectar herança extranuclear
    em fungos filamentosos

   Realizado em Neurospora e Aspergillus

   Conceito: feito com um mutante extra
    nuclear hipotético (crescimento lento) e
    uma linhagem portadora de uma mutação
    nuclear conhecida.
Fundamento genético
   Recuperação do fenótipo nuclear mutado
    do heterocarion em combinação com o
    fenótipo do mutante de crescimento lento
    (que esta sendo testado) – surgiu de ma
    mutação em organela.
   Não ocorre diploidia em um heterocarion,
    não há troca genética entre os nucleos.
   O fenótipo de crescimento lento é
    transferido por contato citoplasmático.
Herança extranuclear
   Pode ser reconhecida pela
    transmissão uniparental
    (geralmente materna) em um
    cruzamento ou pela transmissão via
    contato citoplasmático

   Herança materna serve como
    modelo para reconhecer a herança
    em organelas
Leveduras
Reprodução mista


Diploidia em leveduras
ocorre por fusão
nuclear e não por
meiose (crossing-over)


Meiose ocorre na
formação dos
ascosporros
Leveduras
   Fungos unicelulares
   Não-filamentosos
   Esfericas ou ovais
• Célula parental
        formam uma
        protuberância (broto)
        na superfície externa
        • A medida que
        cresce, o núcleo da
        célula parental se
        divide, e um núcleos
broto   migram para o broto.
        • O material da parece
        celular é então
        sintetizado entre o
        broto e a célula
        parental, e o broto
        acaba se separando da
        célula parental.
Leveduras:
modo de reprodução

Produz 24 células-filhas
por brotamento
Ciclo de vida da levedura

   Alelos nucleares a e α de
    terminam o tipo reprodutivo;

   A fusão nuclear entre haplóide
    a e células α produz células
    diplóides

   Passa por um ciclo mitótico
    (brotamento)

   Durante a esporulação ocorre
    a meiose

   Os brotamentos se tornam
    células filhas
Padrão de herança em leveduras
   Quando os brotos diploides sofrem
    meiose, produtos de cada meiose
    mostram herança uniparental
   Genes nucleares (alelos a e α),
    segregam padrao mendeliano
   Alelos eryR e eryS, determinam a
    resistencia e a sensibilidade a
    eritromicina
Mapeamento genoma mitocondrial
   Genes em leveduras estão ligados
    em um cromossomo mitocondrial ou
    situados em unidades estruturais?

   Mapeamento recombinacional
   Mapeamento pela analise de Petite
   Mapeamento de Restrição
Mapeamento por Recombinação
   Em leveduras, há segregação citoplasmática e
    recombinação durante a formação de brotos em
    citohets diplóides

   A recombinação envolvendo mitocôndrias é um
    fenômeno populacional, semelhante a
    recombinação de fagos

   A ligação é detectável apenas para os genes mais
    próximos

   Processo de recombinação é fortemente
    influenciado por um fator genético especifico
    (omega - ω)
Mapeamento pela analise de Petite
   Mutaçoes petite, antR e mit- são herdadas
    no genoma mitocondrial de leveduras

   Se baseia na descoberta de que os petites
    representam deleções do mtDNA

   Linhagens resistentes a drogas (eryR) como
    indutor de mutantes petite

   eryR x    eryS = formam diplóides que
    formam brotos diploides

   Brotos diplóides são testados quanto a
    resistência drogas
Petites derivados de diploides são
todos eryS?

   O evento mutacional original pelo
    qual surge o fenótipo petite inativa
    ou destrói o fenotipo grande e o
    fenótipo resiste a drogas

   O fenótipo petite é produzido por
    grandes deleções do mtDNA
Class   Genome Size           Acc. #         Code      Total    Basic    Other ORFs       rRNAs      Reference
  Organism
                                         /Structure         /Update                 ORFs        14                       /tRNAs
Allomyces macrogynus           Chy        57,473          NC001715            U        27       all         rps3            2       Paquin and Lang
                                                                                                                                    1996
                                            C                3/96                                                          25
Aspergillus nidulans          Asc-F       33,300            FMGP              S       ~17       all         rps3            2       Brown et al. 1985

                                            C                                                               rnpB          ~22
Candida albicans              Asc-Y       40,420          NC002653            Y        12       all                        2        Anderson et al. 2001

                                            C                1/01                                                          30
Harpochytrium #94              Mon        19,473            FMGP              U        14       all                         2*      FMGP

                                            C                                                                              8#
Harpochytrium #105             Mon        24,570            FMGP              U        14       all                        2*       FMGP

                                            C                                                                              8#
Hyaloraphidium curvatum        Chy        29,593          NC003048            S        18       all                        2*       Forget et al. 2002

                                            L               8/01                                                           7#
Hypocrea jeorina              Asc-F       42,130          NC003388            S        19       all         rps3           2        Chambergo et al.
                                                                                                                                    2002
(Trichoderma reesei)                        C                 2/02                                                         26
Neurospora crassa             Asc-F       64,840           Whitehead          S       ~30       all         rps3            2       Griffiths et al.1995
                                                            Institute
                                            C                                                                              27
Pichia canadensis             Asc-Y       27,694          NC001762            S        17       all         rps3            2       Sekito et al. 1995

(Hansenula wingei)                           C                9/95                                                         25
Podospora anserina            Asc-F       100,300         NC001329            S        50      -atp9        rps3            2       Cummings et al.
                                                                                                                                    1990
                                            C                1/01                                                          27
Rhizopus stolonifer            Zyg        54,178            FMGP              U        19       all         rnpB            2       FMGP

                                             C                                                                             24
[a] Asc = Ascomycete (Y = yeast or non-filamentous, F = filamentous), Bas = Basidiomycete, Chy = Chytridiomycete, Mon = Monoblepharidales, Zyg =
Zygomycete
[b] Genome size in bp; C = circular, L = linear
[c] NCBI accession number or source of information
[d] Genetic code: U = universal; S= standard mitochondria with UGA coding for Trp, rather than termination; Y= yeast codon usage, with AUA coding for
Met, not Ile, CUN = Thr, not Leu, and UGA is Trp, not Ter; C = Chlorophycean mitochondrial code with UAG being Leu, not Ter
[e] Known polypeptides and ORFs greater than 100 amino acids
[f] Fourteen genes common to most fungal mtDNAs; cob, cox1, cox2, cox3, nad1, nad2, nad3, nad4, nad4L, nad5, nad6, atp6, atp8, atp9. Minus signs
indicate the absence of the gene indicated
[g] Additional known genes: rps3 = small ribosomal protein subunit 3 (also includes small ribosomal protein S5 and Var1); rnpB = RNA component of
RNase P. Intron-encoded proteins are excluded
[h] Indicates number of rRNA genes (those with asterisk are split) and tRNA genes (those with # contain members that are edited)
[i] FMGP = Fungal Mitochondrial Genome Project (http://megasun.bch.umontreal.ca/People/lang/FMGP/seqprojects.html)
[j] 86% sequenced
mtDNA leveduras : mtDNA humano

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Herança extranuclear em fungos

  • 1. Herança extranuclear em fungos e em leveduras Profa. Dra. Adriana Dantas UERGS – Bento Gonçalves, RS
  • 2. Fungos  eucariotos  esporos  não-fotossintéticos  nutrição absortiva  modos de reprodução
  • 3. Tipos morfológicos básicos  Leveduras (Células arredondadas)  Micélio (céls.filalmentosas septadas ou não)  Fungos dimórficos
  • 4. Estrutura dos fungos  Fungos filamentosos (bolores)  Unidade estrutural = HIFA  Septada ( dividem as hifas em unidades celulares uninucleadas)  Cenocítica (nao contem septos, celulas longas e continuas com muitos nucleos)  Conjunto de hifas = MICÉLIO
  • 5. Comparação entre fungo e bactérias Fungos Bactérias Tipo de célula Eucariótica Procariótica Membrana celular Esteróis presentes Esteróis ausentes, com exceção do Mycoplasma Parede celular Glicanas, mananas, peptideoglicana quitina Esporos Produz uma grande Endosporos (não variedade de para reproduçao) esporos alguns esporos reprodutivos assexuais sexuais e reprodutivos assexuais Metabolismo Limitado a Heterotrófico, heterotrófico; quimioautotrofico, aeróbico, fotoautotrofico, anaeróbico aeróbico, facultativo anaeróbico facultativo
  • 6. Crescimento das Hifas  Crescimento das hifas é por alongamento das extremidades  Cada parte de uma hifa é capaz de crescer  Fragmento quebrado, esse se alonga e foram uma nova hifa  Em laboratório, os fungos crescem a partir de fragmentos obtidos de um talo de fungo
  • 7. Tipos  Hifas vegetativas – obtêm os nutrientes  Hifas reprodutiva ou aérea  Responsável pela reprodução  Se projeta acima da superfície sobre o qual o fungo esta crescendo  Sustentam os esporos reprodutivos  As hifas crescem formam uma massa filamentosa chamada de micélio, visível a olho nú.
  • 10. Tipos de Esporos Assexuais Aspergillus
  • 11. Cryptococcus neoformans Candida albicans
  • 13.
  • 14. Aplicações dos fungos  Fornecedores de químicos (antibióticos)  Controle biológico  Simbiontes mutualistas  Parasitas  Bebidas e alimentos  Biodegradação  Biotecnologia
  • 15. Neurospora Poky  1952 – Mary Mitchell isolou uma linhagem mutante de Neurospora que chamou de Poky  Caracteristicas (difere do fungo selvagem)  Crescimento lento  Apresenta herança materna  Quantidades anormais de cromossomos
  • 16. Citocromo  São proteínas mitocondriais transportadoras de elétrons  Necessária a oxidação para gerar energia sob a forma de ATP  Três tipos de citocromos:  a, b e c  Em Neurospora não há citocromo a ou b, há um excesso de citocromo c.
  • 17. Herança materna Poky x selvagem selvagem x Poky Selvagem Poky
  • 18. Organismo haplóide  Genitor contribui com a maior parte do citoplasma para a prole  Chamado genitor materno, mesmo que não exista reprodução sexual  Nos cruzamentos poky x selvagem quaisquer genes nucleares que difiram entre as linhagens parentais segrega de modo mendeliano 1:1 na prole  A Prole poky é transmitida por muitas gerações quando cruzado como fêmeas  Poky tem localização extra nuclear (citoplasma)
  • 19. Cruzamentos reciprocos de poky x Neurospora normal  Genitor femea contribui com a maior parte do citoplasma para a prole;  Locus nuclear alelos:  ad+ e ad- (1:1)
  • 20. Mutação poky  Fenótipo mutante envolvem as mitocôndrias  Crescimento lento – deficiência de ATP  Tem quantidades anormais de citocromos  David Luck experimento com marcação com colina radiotiva nas mitocôndrias, concluiu que mitocôndrias se propagam por multiplicação das mitocôndrias pré- existentes.
  • 21. Teste do Heterocarion  Usado para detectar herança extranuclear em fungos filamentosos  Realizado em Neurospora e Aspergillus  Conceito: feito com um mutante extra nuclear hipotético (crescimento lento) e uma linhagem portadora de uma mutação nuclear conhecida.
  • 22. Fundamento genético  Recuperação do fenótipo nuclear mutado do heterocarion em combinação com o fenótipo do mutante de crescimento lento (que esta sendo testado) – surgiu de ma mutação em organela.  Não ocorre diploidia em um heterocarion, não há troca genética entre os nucleos.  O fenótipo de crescimento lento é transferido por contato citoplasmático.
  • 23. Herança extranuclear  Pode ser reconhecida pela transmissão uniparental (geralmente materna) em um cruzamento ou pela transmissão via contato citoplasmático  Herança materna serve como modelo para reconhecer a herança em organelas
  • 24. Leveduras Reprodução mista Diploidia em leveduras ocorre por fusão nuclear e não por meiose (crossing-over) Meiose ocorre na formação dos ascosporros
  • 25. Leveduras  Fungos unicelulares  Não-filamentosos  Esfericas ou ovais
  • 26. • Célula parental formam uma protuberância (broto) na superfície externa • A medida que cresce, o núcleo da célula parental se divide, e um núcleos broto migram para o broto. • O material da parece celular é então sintetizado entre o broto e a célula parental, e o broto acaba se separando da célula parental.
  • 27. Leveduras: modo de reprodução Produz 24 células-filhas por brotamento
  • 28. Ciclo de vida da levedura  Alelos nucleares a e α de terminam o tipo reprodutivo;  A fusão nuclear entre haplóide a e células α produz células diplóides  Passa por um ciclo mitótico (brotamento)  Durante a esporulação ocorre a meiose  Os brotamentos se tornam células filhas
  • 29. Padrão de herança em leveduras  Quando os brotos diploides sofrem meiose, produtos de cada meiose mostram herança uniparental  Genes nucleares (alelos a e α), segregam padrao mendeliano  Alelos eryR e eryS, determinam a resistencia e a sensibilidade a eritromicina
  • 30.
  • 31. Mapeamento genoma mitocondrial  Genes em leveduras estão ligados em um cromossomo mitocondrial ou situados em unidades estruturais?  Mapeamento recombinacional  Mapeamento pela analise de Petite  Mapeamento de Restrição
  • 32. Mapeamento por Recombinação  Em leveduras, há segregação citoplasmática e recombinação durante a formação de brotos em citohets diplóides  A recombinação envolvendo mitocôndrias é um fenômeno populacional, semelhante a recombinação de fagos  A ligação é detectável apenas para os genes mais próximos  Processo de recombinação é fortemente influenciado por um fator genético especifico (omega - ω)
  • 33. Mapeamento pela analise de Petite  Mutaçoes petite, antR e mit- são herdadas no genoma mitocondrial de leveduras  Se baseia na descoberta de que os petites representam deleções do mtDNA  Linhagens resistentes a drogas (eryR) como indutor de mutantes petite  eryR x eryS = formam diplóides que formam brotos diploides  Brotos diplóides são testados quanto a resistência drogas
  • 34. Petites derivados de diploides são todos eryS?  O evento mutacional original pelo qual surge o fenótipo petite inativa ou destrói o fenotipo grande e o fenótipo resiste a drogas  O fenótipo petite é produzido por grandes deleções do mtDNA
  • 35. Class Genome Size Acc. # Code Total Basic Other ORFs rRNAs Reference Organism /Structure /Update ORFs 14 /tRNAs Allomyces macrogynus Chy 57,473 NC001715 U 27 all rps3 2 Paquin and Lang 1996 C 3/96 25 Aspergillus nidulans Asc-F 33,300 FMGP S ~17 all rps3 2 Brown et al. 1985 C rnpB ~22 Candida albicans Asc-Y 40,420 NC002653 Y 12 all 2 Anderson et al. 2001 C 1/01 30 Harpochytrium #94 Mon 19,473 FMGP U 14 all 2* FMGP C 8# Harpochytrium #105 Mon 24,570 FMGP U 14 all 2* FMGP C 8# Hyaloraphidium curvatum Chy 29,593 NC003048 S 18 all 2* Forget et al. 2002 L 8/01 7# Hypocrea jeorina Asc-F 42,130 NC003388 S 19 all rps3 2 Chambergo et al. 2002 (Trichoderma reesei) C 2/02 26 Neurospora crassa Asc-F 64,840 Whitehead S ~30 all rps3 2 Griffiths et al.1995 Institute C 27 Pichia canadensis Asc-Y 27,694 NC001762 S 17 all rps3 2 Sekito et al. 1995 (Hansenula wingei) C 9/95 25 Podospora anserina Asc-F 100,300 NC001329 S 50 -atp9 rps3 2 Cummings et al. 1990 C 1/01 27 Rhizopus stolonifer Zyg 54,178 FMGP U 19 all rnpB 2 FMGP C 24 [a] Asc = Ascomycete (Y = yeast or non-filamentous, F = filamentous), Bas = Basidiomycete, Chy = Chytridiomycete, Mon = Monoblepharidales, Zyg = Zygomycete [b] Genome size in bp; C = circular, L = linear [c] NCBI accession number or source of information [d] Genetic code: U = universal; S= standard mitochondria with UGA coding for Trp, rather than termination; Y= yeast codon usage, with AUA coding for Met, not Ile, CUN = Thr, not Leu, and UGA is Trp, not Ter; C = Chlorophycean mitochondrial code with UAG being Leu, not Ter [e] Known polypeptides and ORFs greater than 100 amino acids [f] Fourteen genes common to most fungal mtDNAs; cob, cox1, cox2, cox3, nad1, nad2, nad3, nad4, nad4L, nad5, nad6, atp6, atp8, atp9. Minus signs indicate the absence of the gene indicated [g] Additional known genes: rps3 = small ribosomal protein subunit 3 (also includes small ribosomal protein S5 and Var1); rnpB = RNA component of RNase P. Intron-encoded proteins are excluded [h] Indicates number of rRNA genes (those with asterisk are split) and tRNA genes (those with # contain members that are edited) [i] FMGP = Fungal Mitochondrial Genome Project (http://megasun.bch.umontreal.ca/People/lang/FMGP/seqprojects.html) [j] 86% sequenced
  • 36. mtDNA leveduras : mtDNA humano